| Beobachtung | Lösungsansatz |
| Das Gel wird nicht fest. | Haben Sie den richtigen Puffer verwendet? Haben Sie die Agarosestammlösung zu lange bei zu hoher Temperatur gehalten? |
| Der TBE-Puffer ist ausgefallen. | Das ist ein häufiges Problem. Nutzen Sie stattdessen TAE-Puffer, oder stellen Sie einen geringer konzentrierten TBE-Puffer her. Autoklavieren sie den ausgefallenen TBE-Puffer; eventuell geht er wieder in Lösung. |
| Die DNA-Fragmente ergeben einen gleichmäßigen Schmier und keine Bande. | Ist Ihre DNA-Probe mit Nukleasen verunreinigt worden. Lagern Sie eventuell Ihre Proben in TE-Puffer, um die Nukleaseaktivität zu hemmen. |
| Die DNA läuft in einem Schmier mit "Nasen". | Verunreinigte DNA-Präparation. Zellbestandteile wie Membranen und Zuckerpolymere können in der Probe vorhanden sein. |
| Es sind keine DNA-Banden erkennbar. | Haben Sie mit DNasen oder anderen Nukleasen gearbeitet? |
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