Agarosegelelektrophorese

Einleitung

Agarosegelelektrophoresen werden in allen molekularbiologischen Laboren zur Kontrolle der Experimente durchgeführt. Drei Vorteile ergeben sich durch diese Methode:

  • Durch dieses Analyseverfahren können Nukleinsäuren nach Anfärben einfach "sichtbar" gemacht werden.
  • Aus der Fluoreszenzintensität gefärbter Nukleinsäurebanden kann die Menge der getrennten Nukleinsäuren abgeschätzt werden.
  • Mit dieser Technik wird die Länge der Nukleinsäuren aus einem Vergleich mit einem DNA-Längenstandard ermittelt.

Sie können einen weiten Bereich an DNA-Fragmentlängen auftrennen. Je kleiner die zu trennenden Fragmente sind, desto höher muss die Agarosekonzentration sein. Für Standardgele wird 0,8%-ige Agarose verwendet. Damit können Sie Plasmide und viele mittellange Fragmente auftrennen.

Glossar

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Agarose

Gelierfähiges Polysaccharid, das aus vielen mit einander verknüpften Zuckerbausteinen aufgebaut ist.

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Elektrophorese

Trennung geladener Teilchen in einem elektrischen Feld. Zusätzlich bildet die Matrix (hier Agarose) Poren, die diese Trennung verbessern. Die Trennung erfolgt nach Ladung pro Molekülvolumen.

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Fluoreszenz

Durch Licht oder andere Strahlung angeregtes Molekül, das in sehr kurzen Zeiten (Nanosekunden) unter Aussendung von Licht (Abgabe der aufgenommenen Energie) wieder in den Grundzustand zurückkehrt.