Sequenzdaten

Pseudomonas aeruginosa Integrase-Gen (1014 bp, 61% G+C-Gehalt)
NCBI : Zugriffsnummer U12338 (Suchergebnis als pdf, 130 KB)

Primer intI.F : 5´-GGGTCAAGGATCTGGATTTCG-3´

Primer intI.R : 5´- ACATGCGTGTAAATCATCGTCG-3` = Gegenstrang: 3´-cgacgatg atttacacgc atgt-5´
Die Lage der Primer in der Nukleotidsequenz des Gens ist durch die roten Buchstaben gekennzeichnet.

Amplifikat-Länge: 484 bp (63% G+C-Gehalt)

Schnitte im Amplifikat:

REFragmentlängen (Bp)
PvuII113371
AcuI159325
BglI163321
BccI295189

 

1 atgaaaaccg ccactgcgcc gttaccaccg ctgcgttcgg tcaaggttct ggaccagttg
61 cgtgagcgca tacgctactt gcattacagt ttacgaaccg aacaggctta tgtcaactgg
121 gttcgtgcct tcatccgttt ccacggtgtg cgtcacccgg caaccttggg cagcagcgaa
181 gtcgaggcat ttctgtcctg gctggcgaac gagcgcaagg tttcggtctc cacgcatcgt
241 caggcattgg cggccttgct gttcttctac ggcaaggtgc tgtgcacgga tctgccctgg
301 cttcaggaga tcggaagacc tcggccgtcg cggcgcttgc cggtggtgct gaccccggat
361 gaagtggttc gcatcctcgg ttttctggaa ggcgagcatc gtttgttcgc ccagcttctg
421 tatggaacgg gcatgcggat cagtgagggt ttgcaactgc gggtcaagga tctggatttc
481 gatcacggca cgatcatcgt gcgggagggc aagggctcca aggatcgggc cttgatgtta
541 cccgagagct tggcacccac gctgcgcgag cagctgtcgc gtgcacgggc atggtggctg
601 aaggaccagg ccgagggccg cagcggcgtt gcgcttcccg acgcccttga gcggaagtat
661 ccgcgcgccg ggcattcctg gccgtggttc tgggtttttg cgcagcacac gcattcgacc
721 gatccacgga gcggtgtcgt gcgtcgccat cacatgtatg accagacctt tcagcgcgcc
781 ttcaaacgtg ccgtagaaca agcaggcatc acgaagcccg ccacaccgca caccctccgc
841 cactcgttcg cgacggcctt gctccgcagc ggttacgaca ttcgaaccgt gcaggatctg
901 ctcggccatt ccgacgtctc tacgacgatg atttacacgc atgtgctgaa agttggcggt
961 gccggagtgc gctcaccgct tgatgcgctg ccgcccctca ctagtgagag gtag